Туркестанская рысь — уязвимый, сокращающийся и мозаично распространённый подвид, включённый в Красную книгу Узбекистана, Красный список Международного союза охраны природы (МСОП), а также в Приложение II CITES. В заповеднике встречается на участках Гелон, Мираки, Танхозардарья и Кызылсув.
Гиссарский государственный заповедник был основан в 1983 году. На его территории обитает 276 видов беспозвоночных (насекомых) и позвоночных животных. Из них 8 видов включены в Красную книгу Узбекистана.