Qarorga ko`ra, O`zbekiston Islom akademiyasida huzurida 2 yillik magistratura, 3 yillik tayanch doktorantura va 3 yillik doktorantura faoliyat yuritadi.
Shuningdek, Akademiyada mustaqil tadqiqotchilar uchun masofadan o`qish, tadqiqot ishlarini mustaqil olib borish imkoniyati yaratiladi, xorijdan doktorantlar va tadqiqotchilar o`qish va amaliyotga shartnoma asosida qabul qilinadi.
Magistraturaga oliy ta`lim muassasalarining kamida bakalavr darajasi diplomiga ega bo`lgan, Akademiyada tayyorlanadigan mutaxassisliklar ixtisosligiga mos keladigan yo`nalishlarni bitirgan O`zbekiston va xorijiy davlatlar fuqarolari qabul qilinadi.
Akademiyada “Qur`onshunoslik”, “Fiqh ilmi”, “Hadisshunoslik” va “Kalom ilmi” mutaxassisligi bo`yicha magistrlarni, shuningdek ushbu sohada chuqur tadqiqotlar olib boruvchi ilmiy va ilmiy-pedagog kadrlar tayyorlanadi.
